Las poblaciones amazónicas han sido blanco de las acciones militaristas del Plan Colombia; como chivos expiatorios de una estrategia geopolítica y militar de los Estados Unidos y del gobierno colombiano. Las primeras repercusiones de esta agresión contra la población se sienten en especial en el departamento del Putumayo. Las cifras de expulsados de sus tierras y de su país por las fumigaciones y la dinámica del conflicto armado son alarmantes. Durante el año 2000 se desplazaron del Putumayo hacia el Ecuador 9.698 personas. Entre finales de 1999 y septiembre de 2001, han emigrado forzadamente hacia el departamento de Nariño 7.443 personas. Se han asistido, dentro del programa de atención a población afectada por la erradicación forzada, 38.038 personas, hasta agosto de 2001. Pero las dimensiones del problema son mayores y estas cifras son parciales. En la actualidad la conflagración armada se ha incrementado y el paramilitarismo se ha extendido; las fumigaciones aéreas suspendieron solo momentáneamente con los "pactos sociales" firmados entre las comunidades y el gobierno nacional. Bajo la amenaza de las fumigaciones aéreas, como dicen los líderes de la región: "...las comunidades firmaron pensando que era el medio para detener una nueva fumigación con sus letales consecuencias".

Con estas políticas se agudiza el conflicto armado, se alimenta a los actores armados y se ahogan las iniciativas ciudadanas, de las comunidades campesinas e indígenas del área. Es necesario buscar para la región amazónica salidas integrales, sostenibles y participativas; reconocer que la mayoría de sus problemas han tenido su origen por fuera de ella. El imaginario que ve a la Amazonia como un espacio de extracción de recursos y el lugar donde inevitablemente llegan los expulsados por el desarrollo agrario capitalista, es en buena parte el causante de los complejos problemas que se han ido gestando en esta región. Continuar con las prácticas extractivistas destruye una de las regiones con mayor diversidad cultural y biológica del mundo.